Naš imunološki sustav djeluje pod temeljne pretpostavke da je "samo" je različita od "ne-ja". Njegova primarna funkcija leži u razlikovanju između tih entiteta, ostavljajući bivši sama dok napadaju druge. Ipak, sada znamo da je naša crijeva su dom populacije bakterijskih stanica, tako velika da se brojno nadmašiti svoje stanice, i da su ti mikrobiota su bitne za naš vlastiti opstanak.
Kao što je nedavno istraživanje u časopisu Nature Immunology bilješke ", ravnoteža je uspostavljena između mikrobiota i imunološki sustav koji je od temeljne važnosti za crijevne homeostaze." Kako imunološki sustav se to postigne ravnoteža, niti overacting i napadaju simbiotske bakterije, niti se slab i dopuštajući patogena da se kroz? Ispada da je naš crijevo bakterije manipulirati imunološki sustav kako bi stvari iz uzimajući vanjska strana od ruku.